Sessão 1 (2h) Introdução: apresentação do curso; aspetos práticos e logísticos; introdução à citometria de fluxo (fundamentos teóricos); apresentação dos formandos, incentivando-se a apresentação de casos de estudo

Sessão 2 (4h) A citometria de fluxo aplicada a estudos de DNA: determinação do tamanho do genoma, análise de ciclo nuclear; caracterização do nível de plodia; plantas, fungos e mutualistas; bases de dados públicas; padrões de DNA (a lista de J. Doležel e os novos padrões de plantas e fungos selecionados no ISA); estratégias de gating

Sessão 3 (4h) Análise experimental de exemplos pré-definidos: análise prática de um conjunto de plantas e fungos selecionados de forma a ilustrar diversas situações práticas, incluindo a identificação dos padrões mais adequados

Sessão 4 (5h) Análise de casos apresentados pelos formandos: organização dos casos de acordo com a tipologia e objetivo, criando grupos de trabalho; delineamento e recolha de informação, seleção de padrões e análise experimental

Sessão 5 (2h) Avaliação e análise dos resultados: parâmetros de qualidade; análise estatística; publicação de dados de citogenómica

Sessão 6 (1h) Manutenção do equipamento, gestão do laboratório de citogenómica e aplicações avançadas: cuidados diários, verificações e manutenções programadas; seriadores celulares; novos desafios e oportunidades de investigação.

Este curso tem como base:

-um equipamento otimizado para estudos de citogenómica - citómetro de fluxo CyFlow Space (Sysmex) equipado com uma fonte emissora a 532 nm para excitação ótima de PI;

-uma coleção de padrões de DNA selecionados por J. Doležel na gama 1,11 – 33,5 pg DNA (espécies vegetais), acrescida de outros padrões selecionados no ISA: padrões vegetais alternativos de elevada resolução; padrões na gama 0,042 – 0,208 pg obtidos de diversas espécies de fungos;

-um protocolo para extração de núcleos (procedimento de D. Galbraith e tampão de J. Loureiro) incluindo otimizações adicionais 

O curso tem como objetivo conferir formação teórica e prática avançada na utilização de citometria de fluxo para estudos de DNA, permitindo:

-a sua utilização a jusante no ensino da Genética, Genómica, Ecologia, Botânica e Micologia;

-formar técnicos com capacidade para delinear e conduzir autonomamente estudos envolvendo a citometria de fluxo como ferramenta para estudos de DNA no âmbito da determinação do tamanho do genoma, análise de ciclo nuclear e caracterização do nível de ploidia.